微生物学4区sci期刊：Journal Of Medical Microbiology，低分好中刊物

　　今天介绍一本微生物学4区sci期刊：Journal Of Medical Microbiology，是经同行评议的国际期刊，最新影响因子2.4，是4区刊物，是评审人员可选的低分好中期刊。

　　期刊基本信息介绍如下：

　　期刊名称：Journal Of Medical Microbiology

　　ISSN：0022-2615

　　eISSN：1473-5644

　　IF/JCR分区：2.4/Q3Citescore: 5.2

　　中科院分区：医学4区

　　发行地区：英国

　　发行周期：月刊

　　期刊分类：医学(大类)，微生物学(小类)

　　是否SCIE收录：是

　　出版模式：hybrid

　　研究方向：是医学、牙科和兽医微生物学的跨学科期刊，发表医学领域细菌学、病毒学、真菌学和寄生虫学相关原创研究。

　　接收文章类型：Research Article、Short Communication、Review、Insight Review、Method、Letter、Personal View、Editorial

　　审稿周期：4.5月(仅供参考)

　　出版费：OA形式发表，要收出版费及增值税。

　　主页链接：https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/jmm/

　　投稿链接：https://www.editorialmanager.com/jmm/Default.aspx

　　作者指南：https://www.microbiologyresearch.org/information-for-authors

　　期刊近期征收的3篇文章参考：

　　01运用全基因组测序法研究耐碳青霉烯类奇异变形杆菌的分子特征和同源性

　　02深部感染近平滑念珠菌复合种亚型对九种抗真菌药物的体外敏感性

　　03对肝细胞癌患者肠道菌群改变的相关性分析：红蝽杆菌、奇异菌、粪球菌及殊异韦荣菌组合检测可能成为新的HCC诊断法

　　01运用全基因组测序法研究耐碳青霉烯类奇异变形杆菌的分子特征和同源性(开放获取)

　　作者：Mi Liu, Dan Li, Wei Jia, Jie Ma, Xue Zhao

　　作者机构：潍坊市人民医院检验科

　　引言：奇异变形杆菌属于肠杆菌科，对多种抗菌药物有天然耐药性。近年来，不断有关于耐碳青霉烯类奇异变形杆菌(CR-PMI)导致爆发严重院内感染的报告。中国和其他地区很少对这种细菌的全基因组分子特征进行研究，这成为我们的研究动机。

　　假设CR-PMI菌株含有多重耐药基因，对常用抗菌药物有高耐药率。

　　目的本文旨在鉴定CR-PMI菌株的耐药机制和同源性，并为临床治疗和控制院内感染提供理论依据。

　　研究方法

　　运用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法鉴定细菌种类。运用VITEK 2系统和Kirby-Bauer(K-B)纸片扩散法测定抗菌药敏感性。全基因组测序(WGS)通过Illumina平台NovaSeq测序系统进行。通过运行Abricate软件的NCBI数据库鉴定抗生素耐药基因(ARG)。运用基因组流行病学中心(Center for Genomic Epidemiology)提供的PlasmidFinder鉴定质粒复制子的类型。

　　研究结果

　　2019年7月至2021年9月采自我院的5个CR-PMI菌株几乎对所有抗菌药物具有耐药性，但氨曲南(ATM)、阿米卡星(AMK)和头孢替坦(CTT)除外。所有CR-PMI菌株都含有碳青霉烯类耐药基因新德里金属-β-内酰胺酶 1(blaNDM-1)，两个菌株含有超广谱β-内酰胺酶(ESBL)基因blaPER-4和blaCTX-M-65。5个CR-PMI菌株分别包含27、18、30、25和24种耐药基因。大多数抗菌药耐药基因都接受了氨基糖苷类检测(n=14)，其次是头孢菌素类(n=7)。系统发育树分为五个进化组，五个CR-PMI菌株分属B-E四个进化组。

　　研究结论

　　总体而言，CR-PMI菌株对常用抗菌药物具有高耐药率，并含有碳青霉烯类耐药基因blaNDM-1。CR-PMI菌株在不同时期的不同病房呈多克隆趋势。最重要的是，所有被鉴定菌株都含有重要的抗菌素耐药基因，这可能导致严重的耐药性传播和致命的多重耐药细菌感染。

　　关键词碳青霉烯类耐药性，奇异变形杆菌，同源性，耐药机制

　　02深部感染近平滑念珠菌复合种亚型对九种抗真菌药物的体外敏感性(开放获取)

　　作者：Wei Zhang, Minghua Zhan, Na Wang, Jingjing Fan, Xuying Han, Caiqing Li, Jinlu Liu, Jia Li, Yongwang Hou, Xinsheng Wang, Zhihua Zhang

　　作者机构：河北北方学院附属第一医院检验科疑难重症及罕见病国家重点实验室检验科北京大学人民医院检验科河北北方学院附属第一医院感染科河北北方学院附属第一医院呼吸与危重症医学科

　　引言：近平滑念珠菌复合种可分为狭义近平滑念珠菌、拟平滑念珠菌和似平滑念珠菌亚型。对其进行分型的药物敏感性测试并不常见。

　　空白声明在常规药敏性报告中，缺乏近平滑念珠菌复合种亚型的药物敏感性数据。

　　目的本研究旨在探讨引起患者深部感染的近平滑念珠菌复合种亚型的抗真菌药敏性和临床分布特征。

　　研究方法

　　收集2017年至2019年从深部感染中分离出的近平滑念珠菌复合种非重复菌株。运用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法进行种级鉴定，并酌情运用ITS基因测序法进行确认。运用Sensititre YeastOne系统法进行抗真菌药敏性试验。

　　研究结果

　　本研究共纳入244个病例，其中男性176例(72.13%，60.69±13.43岁)，女性68例(27.87%，60.21±10.59岁)。主要疾病为癌症(43.44%)、心血管疾病(25.00%)、消化系统疾病(18.44%)、感染(6.97%)和肾病(6.15%)。菌株从血流(63.11%)、中心静脉导管(15.16%)、脓液(6.56%)、腹水(5.74%)、无菌体液(5.33%)和支气管肺泡灌洗液(BALF，4.09%)中分离。在244个近平滑念珠菌复合种菌株中鉴定出179种(73.26%)狭义近平滑念珠菌，62种(25.41%)拟平滑念珠菌，3种(1.23%)似平滑念珠菌。

　　只有1个狭义近平滑念珠菌菌株对阿尼芬净(anidulafungin)、米卡芬净(micafungin)、卡泊芬净(caspofungin)和伏立康唑(voriconazole)有抗药性，并且是对两性霉素B(amphotericin B)耐药的非野生型(NWT)菌株。此外，6个狭义近平滑念珠菌菌株对氟康唑(fluconazole)耐药，1个为剂量依赖性敏感菌株。5个狭义近平滑念珠菌菌株是对泊沙康唑(posaconazole)耐药的非野生型菌株。只有1个拟平滑念珠菌菌株是对阿尼芬净、米卡芬净、卡泊芬净、氟康唑、伏立康唑、两性霉素B和泊沙康唑耐药的非野生型菌株，其余菌株均为野生型。

　　研究结论

　　狭义近平滑念珠菌是我院近平滑念珠菌复合种的主要临床分离株。大多数菌株是从血流中分离。对常用抗真菌药物的药敏率超过96%。此外，受感染的患者多为老年男性癌症患者。

　　关键词唑类，近平滑念珠菌复合种，耐药性，棘白菌素，野生型

　　03对肝细胞癌患者肠道菌群改变的相关性分析：红蝽杆菌、奇异菌、粪球菌及殊异韦荣菌组合检测可能成为新的HCC诊断法(开放获取)

　　作者：Wenqian Xu, Yan Jiang, Jinglong Tao, Yunhong Liu, Yongwu Xia, Cheng Chen, Xiaoxin Jiang

　　作者机构：

　　深圳市龙华区人民医院医学检验科武警湖南总队医院检验科湖南省直中医医院医学检验科

　　引言肝细胞癌(HCC)是世界上最常见的恶性肿瘤之一。由于其具有早期诊断率低、恶性程度高、病情进展快的特点，确诊患者大多处于中晚期。越来越多的证据表明，肠道菌群失调会扰乱免疫调节(尤其是白细胞介素表达)，从而加重肝细胞癌的病情。因此，基于肠道菌群的方法有可能成为诊断或治疗肝细胞癌的新方法。

　　假设肝细胞癌患者和健康人群的肠道菌群组成不同。此外，肠道菌群可能减轻或加重肝细胞癌。

　　研究方法

　　为了确认哪些肠道菌群和白细胞介素会加重肝细胞癌，我们研究了肝细胞癌患者与健康人群之间的肠道菌群组成和白细胞介素(IL)指数差异。我们共招募64名肝细胞癌患者和24名健康人，采集其新鲜粪便样本和血清样本进行16S rRNA测序和代谢物指数测定。

　　研究结果

　　数据显示，在肝细胞癌组和对照组中分别检测到484个和476个操作分类单元(OTU)。从门一级到种一级，有5、6、10、15、23和19个菌落在肝细胞癌组与健康人群之间显示出丰度差异。此外，白细胞介素-6和白细胞介素-10的表达在两组间也有显著差异。值得注意的是，两组的红蝽杆菌(Coriobacterium)、奇异菌(Atopobium)、粪球菌(Coprococcus)属级差异和殊异韦荣菌(Veillonella dispar)种级差异与IL-6和IL-10明显相关。

　　研究结论

　　肝细胞癌组肠道菌群的丰度与对照组不同。此外，红蝽杆菌(Coriobacterium)、奇异菌(Atopobium)、粪球菌(Coprococcus)属级及殊异韦荣菌(Veillonella dispar)种级组合检测可能是一种新的肝细胞癌诊断法。

　　关键词肝细胞癌，白细胞介素，肠道菌群，代谢物

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