《中华骨科杂志》发表论文赏析
作者:王月磊,林毓涵,李昭辉,刘家明,张强,连小峰,沈峰,殷楚强,韩增帅,王华锋,王亭
单位:青岛大学附属医院,福州市第二总医院,青岛大学,南昌大学第一附属医院,山东大学附属公共卫生临床中心,上海交通大学附属第六人民医院,青岛大学附属医院,青岛大学附属医院,青岛大学附属医院,福州市第二医院,青岛大学附属医院
摘要:目的 探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)对脊柱化脓性感染的诊断价值。方法 纳入2022年9月至2024年9月青岛大学附属医院、福州市第二总医院、南昌大学第一附属医院、山东大学附属公共卫生临床中心、上海交通大学医学院附属第六人民医院共255例明确诊断为化脓性脊柱感染患者,男155例、女100例,年龄(62.5±14.2)岁(范围13~90岁)。所有患者均采集感染部位组织和(或)脓液标本进行微生物培养和mNGS检测。比较微生物培养与mNGS检出的病原体数量、种类及阳性率。以培养结果为金标准,对mNGS检测和mNG联合微生物培养方法进行受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析,计算曲线下面积(area under curve,AUC)及95% 。 结果 255例化脓性脊柱感染患者中194例获得病原学证据,最常见的革兰阳性菌为金黄色葡萄球菌、革兰阴性菌为大肠埃希菌。mNGS共检出33种病原微生物,微生物培养共检出18种病原微生物,mNGS的阳性率为72.2%(184/255),高于微生物培养的30.2%(77/255),差异有统计学意义(χ =90.150, 0.001);mNGS联合微生物培养的阳性率为76.1%(194/255),高于单纯mNGS的阳性率,差异有统计学意义(χ =8.100, 0.001)。在178例培养阴性样本中,mNGS检出率为65.7%(117/178);在77例培养阳性的样本中,mNGS检出率为87.0%(67/77),在检出病原菌的样本中有97.0%(65/67)在种水平上与培养一致。mNGS检测、mNGS联合微生物培养的ROC曲线的AUC分别为0.606[95% (0.534,0.678)]和0.671[95% (0.606,0.736)],与微生物培养比较差异有统计学意义( =0.007, 0.001)。 结论 mNGS技术较微生物培养在化脓性脊柱感染病原学诊断方面具有优势,与微生物培养联合可提高检出率。
关键词:序列分析,DNA;微生物学技术;病原;精准医学;宏基因组二代测序;化脓性脊柱感染
基金资助:国家重点研发计划2023YFC2812004