《中华骨科杂志》发表论文赏析
作者:蔡震宇,佘艳春,谢璐,王涵,杜志业,李原,任婷婷,许婕,孙馨,孙昆昆,沈丹华,汤小东,郭卫
单位:北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院,北京大学人民医院
摘要:目的 探讨初始骨转移与肺转移的骨肉瘤基因组学表现差异及发病机制。方法 收集2021年5月1日至10月1日于北京大学人民医院诊治的38例高级别骨肉瘤患者肿瘤新鲜标本及部分石蜡包埋标本,男29例、女9例,年龄(19.6±2.2)岁(范围6~61岁)。38例中12例发生初始骨转移、26例发生初始肺转移,其中15例(40%,15/38)具有原发灶和转移灶的配对标本。应用Illumina NovaSeq 6000平台进行全外显子测序及转录组测序,并随治疗进程获取肿瘤演进过程中的新鲜配对标本,分析不同进展模式的骨肉瘤配对标本的全外显子组测序数据,进一步根据其基因型表现进行疾病亚分类,将基因学表现与临床过程进行关联。结果 骨转移组以单核苷酸变异为主(83%,10/12),肺转移组以结构变异为主(58%,15/26)。骨转移组的肿瘤突变负荷为4.9(2.8,12.0)、新抗原负荷为743.0(316.5,1 034.5),较肺转移组的2.4(1.4,4.5)和128.5(49.0,200.5)更高,差异均有统计学意义( =0.010, =0.003)。突变谱示骨转移组[0.33(0.13,0.60)]和肺转移组[0.10(0.00,0.13)]在与年龄有关的基因特征1上的差异有统计学意义( =0.005)。以随机表法每组各选择3例患者进行多色免疫荧光染色,骨转移组中1例发现了三级淋巴结构。通过对配对标本进行进化图谱分析发现骨肉瘤配对标本的已知基因呈高度保守。 结论 以单核苷酸变异为主而非结构变异的骨肉瘤可能容易发生初始骨转移,此类患者年龄更大,肿瘤微环境的免疫源性可能更高。
关键词:骨肉瘤;肿瘤转移;基因组学;染色体结构变异;单核苷酸变异
基金资助:国家自然科学基金81972509,82072970