宏基因组二代测序技术在脊柱非结核感染性疾病诊断中的应用价值

来源：中华骨科杂志2022年第15期北京时间：

作者：石仕元,胡胜平,费骏,汪翼凡,赖震,陈根君

单位：浙江大学医学院附属杭州市胸科医院,浙江大学医学院附属杭州市胸科医院,浙江大学医学院附属杭州市胸科医院,浙江大学医学院附属杭州市胸科医院,杭州市红十字会医院,浙江大学医学院附属杭州市胸科医院

摘要：目的 探讨宏基因组二代测序技术（metagenomic next generation sequencing，mNGS）在除结核、非结核分枝杆菌感染以外的脊柱感染性疾病诊断中的应用价值。方法 回顾性分析了2019年1月至2020年11月收治的疑似脊柱非结核感染性疾病患者171例的临床资料，全部患者接受脊柱病灶穿刺活检或开放手术获取组织标本，进行组织病理学检查，病灶脓血液或灌洗液均行常规细菌培养及mNGS测序。比较两种检测手段在报告时间、敏感度（阳性率）、特异度（真阴性率）等方面的差异，分析脊柱感染病原微生物谱，分析标本采集方法、术前抗生素使用、标本类型对病原微生物检出的影响。结果 根据脊柱非结核感染性疾病诊断标准明确感染136例，其中明确病原微生物111例。报告时间常规细菌培养为（81.67+15.52）h，mNGS为（36.33+11.92）h。常规细菌培养阳性43例，假阳性5例，敏感度31.62%，特异度85.71%；mNGS阳性76例，假阳性19例，敏感度55.88%，特异度45.71%。mNGS与常规细菌培养在病原微生物检出敏感度、特异度、报告时间的差异均有统计学意义。非特异性感染病原微生物检出前3位分别为金黄色葡萄球菌及葡萄球菌属、大肠埃希菌、链球菌属。除结核、非结核分枝杆菌外确诊11例特异性感染患者，常规细菌培养阳性2例，mNGS测序真阳性11例，mNGS对少见病原微生物具有较高的检出率。Logistic回归分析提示术前4周规范抗生素使用、标本获取方法对常规细菌培结果有明显影响，而标本获取方法对mNGS测序结果无影响。结论 宏基因组二代测序技术诊断非结核脊柱感染性疾病对病原微生物检出具有较高的敏感度，特别是对少见病原微生物的检出具有明显优势，具有较高的诊断价值。

关键词：脊柱;感染;宏基因组;高通量核苷酸序列分析

基金资助：杭州市农业和社会发展科研主动设计项目20180417A04