从江香猪基因组甲基化修饰与体重之间的相关性研究

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第4期北京时间：

作者：林如涛, 冉雪琴, 王嘉福

单位：1. 贵州大学省农业生物工程研究院, 贵阳 550025;2. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;3. 贵州大学生命科学学院, 贵阳 550025

摘要：为了探索从江香猪生长慢的表观遗传学机理,本试验应用甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplifying polymorphism,MSAP)技术,将60头20 d从江香猪分为高体重组和低体重组,研究血液和肝脏基因组DNA中胞嘧啶的甲基化程度,并测定差异的甲基化片段核苷酸序列.结果发现,MSAP分析得到5 977条带;与低体重组相比,高体重组的血液和肝脏总甲基化水平较低,两组的血液半甲基化水平均较肝脏中的高,全/总甲基化水平较低.提示香猪血液和肝脏基因组的总甲基化程度随体重的增加而下降.经克隆测序得到5条有差异的甲基化条带A1-A5,其中A1和A2源自血液,A3-A5来自肝脏;A1和A4片段为高体重组特有,其余3条片段为低体重组特有;A3片段未找到相关基因,其他4个片段处于代谢或免疫相关的基因内部或5'侧翼区.提示从江香猪基因组的甲基化水平存在个体差异,并与20 d体重相关;得到的4条甲基化片段,将有助于香猪甲基化调控机制的研究.

关键词：从江香猪;基因组甲基化;差异片段;体重

基金资助：国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2013AA102503);贵州省农业科技攻关项目(黔科合NY[2013]3073号);贵州省科技创新人才团队建设专项;贵州省动物遗传育种与生物技术科技创新人才团队(黔科合人才团队2009-4006);贵州大学“本科教学工程”项目(BKJX2012007)