水牛脑源性神经营养因子基因克隆、序列分析及其在不同组织中的表达研究

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第4期北京时间：

作者：杜凤娇, 刘晓淋, 吴柱连, 李小楷, 屈春凤, 赵鑫, 雷钏, 阮秋燕, 陆凤花, 石德顺

单位：广西大学, 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 南宁 530004

摘要：本研究克隆了水牛脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)基因序列,并运用生物信息学方法对序列的同源性、生物进化树、蛋白的理化性质及二、三级结构等进行了分析预测,同时利用QRT-PCR方法研究了BDNF mRNA在胎儿水牛及成年水牛不同组织中的表达情况.结果表明,应用RT-PCR技术克隆获得了长800 bp水牛BDNF基因序列,其中编码区全长753 bp,编码250个氨基酸.多重序列比对分析显示,水牛BDNF核苷酸序列与黄牛、野猪、犬、人、马、小鼠同源性分别为99%、94%、93%、90%、90%和89%;生物进化树分析显示,BDNF基因在不同物种进化过程中具有较高的保守性;BDNF蛋白理论分子质量28 173.36 u,等电点9.12;蛋白二级结构由多个α-螺旋、β-折叠、T-转角及无规则卷曲组成,三级结构由多个α-螺旋、3对反向平行的β-折叠结构等构成活性中心(即NGF功能结构域).QRT-PCR结果显示,BDNF mRNA在胎儿水牛及成年水牛的心脏、肺脏、肾脏、大脑、肌肉、卵巢、睾丸组织中都有表达,且成年水牛的表达量高于胎儿水牛.

关键词：水牛;BDNF;克隆分析;表达模式

基金资助：国家农业部转基因重大专项(2011ZX08007-003);国家高技术研究发展计划(863)项目(2011AA100607);国家自然科学基金项目(31160457);广西科学基金项目(2011GXNSFA018084、2012GXNSFFA060004)