五指山猪线粒体控制区序列分析及遗传多样性研究

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第5期北京时间：

作者：于萍, 曹婷, 施力光, 刘雅芳, 赵春萍, 张立岭, 侯冠彧

单位：1. 海南大学农学院, 海口 570228;2. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 儋州 571737

摘要：为了研究五指山猪遗传多样性和系统地位,本研究采用PCR产物直接测序法得到55条五指山猪线粒体控制区(mtDNA D-Loop)全序列,并结合GenBank中发表的1条五指山猪mtDNA D-Loop全序列进行结构分析、遗传多样性研究及系统发育分析。结果发现,56条序列中出现21次保守区变异,即"TTATAAAACAC"序列重复,共定义13个单倍型,发现14个变异位点,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.838和0.00334,表明五指山猪遗传多样性较丰富。五指山猪线粒体控制区序列构建的系统发育树和Network网络分析呈现两大分支,推测有两个母系起源,且与GenBank中其他23个猪种的聚类结果表明,五指山猪与长江流域以南地区的猪种有着较近的亲缘关系。

关键词：五指山猪;线粒体控制区;遗传多样性

基金资助：家养动物种质资源平台运行服务;中央级公益性科研院所基本业务费(1630032013020)