绵羊骨形态发生蛋白4(BMP4)的生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第6期北京时间：

作者：樊振华, 张秋月, 范瑞文, 任玉红

单位：1. 山西省农业科学研究院畜牧兽医研究所, 太原 030032;2. 山西农业大学动物科技学院, 太谷 030801

摘要：为探究绵羊骨形态发生蛋白4(bone morphogenetic protein 4,BMP4)的生物学特性,本试验综合运用NCBI、DNAMAN、DNAStar、TMHMM Server v.2.0、PsortⅡ、SignalP等多种生物信息学软件推测绵羊BMP4基因序列性质及编码蛋白的理化性质、疏水性、磷酸化位点、保守性结构域和二级结构,并用SWISS-MODEL Workspace预测三维结构.结果显示,绵羊BMP4基因与各物种的BMP4基因存在很高的同源性,编码蛋白是一个不稳定的亲水蛋白,不存在跨膜区,很可能位于细胞核中,且存在信号肽.BMP4具有18个磷酸化位点,通过功能域的预测发现,含有2个功能域,即TGF-β超家族和TGF-β前肽超家族.这与BMP4基因家族的功能相一致,证明了绵羊BMP4是一种生长因子,具有信号传导功能.蛋白三维结构预测结果与模板3bmp.1.A同源性达到了88.29%.绵羊BMP4基因的生物信息学分析可为以后实践中深入研究其功能提供参考.

关键词：绵羊;骨形态发生蛋白4(BMP4);功能预测;生物信息学

基金资助：山西省科技攻关项目(20140311019-3)