广西5个猪种和国外3个猪种mtDNA D-loop序列遗传多样性及进化分析

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第7期北京时间：

作者：张冰, 廖海洪, 农素群, 马青艳, 孙俊丽

单位：1. 广西家畜遗传改良重点实验室, 南宁 530001;2. 广西壮族自治区畜牧研究所, 南宁 530001

摘要：为了比较广西猪种和国外3个猪种的遗传资源多样性和进化关系,利用文献报道的1对引物测定了广西5个地方猪种(巴马香猪、东山猪、桂中花猪、陆川猪、环江香猪)共85个样本的mtDNA D-loop序列,结合已报道的国外3个猪种(杜洛克猪、大约克猪和长白猪)的45条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性和系统发育树分析。结果表明,8个群体样本的130条序列共定义38种单倍型;广西各猪种之间遗传距离较小,远小于其与国外猪种杜洛克猪、长白猪间的遗传距离;构建的NJ分子系统进化树将所分析样本分为2个独立的支系:一支包含了所有广西地方猪种和部分大约克猪的单倍型,另一支则全部是3个国外猪种的单倍型,广西猪种和3个国外猪种有着两个明显不同的母系起源。陆川猪在系统树上分布较为紧密,其他4个猪种都很分散,表明陆川猪母源血统单一,其他4个猪种母源血统遗传背景比较复杂,彼此之间有基因交流。广西猪种母系资源没有受到国外引进猪种资源的影响,在其开发利用中依然适合用作母本。

关键词：广西猪种;国外猪种;线粒体DNA控制区;遗传多样性;系统进化

基金资助：广西自然科学基金项目(2012GXNSFAA053071、2013GXNSFB019115)