飞行时间质谱法检测水牛黑素皮质素受体4基因多态性

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第7期北京时间：

作者：邓廷贤, 庞春英, 朱鹏, 段安琴, 陆杏蓉, 杨炳壮, 梁贤威

单位：中国农业科学院广西水牛研究所, 农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室, 南宁 530001

摘要：应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)检测水牛黑素皮质素受体4(MC4R)基因的多态性(SNPs),为今后建立水牛辅助标记选择策略奠定基础。以水牛MC4R基因序列为模板,利用PCR扩增测序法筛查了水牛MC4R基因13个SNPs。为进一步验证筛选的可靠性,应用MALDI-TOF-MS针对380头水牛检测了8个标记的基因型。结果显示,平均检出率为98.0%,能够准确的检测出3种常见的基因型。所检SNP位点的平均最小等位基因频率(MAF)为0.24,平均杂合度为0.28,平均多态信息含量(PIC)为0.23。本研究建立的基于PCR测序法联合MALDI-TOF-MS检测水牛MC4R基因多态性的方法,具有快速、可靠和准确的特点,为今后开展水牛生产性状基因的SNP分型和检测等研究奠定了基础。

关键词：水牛;飞行时间质谱;黑素皮质素受体4基因;SNPs

基金资助：国家国际科技合作专项项目(2014DFA31970);桂渔牧科(1304512);水牛基(1404001)