CODEHOP克隆鲫鱼HSP90基因及其同源性分析

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第8期北京时间：

作者：焦雪, 张雅斌, 卢玉婷, 祖岫杰, 张培军, 李月红

单位：1. 吉林农业大学动物科学学院, 长春 130118;2. 吉林省水产科学研究院, 长春 130000;3. 吉林省卫生监测检验中心, 长春 130000

摘要：本研究旨在分析热休克蛋白90(HSP90)基因的保守性,并为寻找新的HSP基因,探索HSP90的应用提供理论数据。利用CODEHOP设计简并引物,采用PCR方法克隆鲫鱼的HSP90序列,并将扩增的序列克隆到pMD18-T载体中构建克隆载体后进行测序,再将测序结果通过BLAST进行同源性比对并构建系统进化树。结果显示,鲫鱼与鲤鱼的同源性为99%;与斑马鱼的同源性为92%。本试验设计出的引物简并度较低,Tm值的修改较为灵活,产物特异性强,为研究鲫鱼的功能基因提供基础保障,并为热休克蛋白在进化上的保守性研究奠定理论基础。

关键词：鲫鱼;简并引物;HSP90

基金资助：国家自然科学基金(30972191);农业部948项目(2014Z34);吉林省教育厅"十二五"科学技术研究重点项目(201443)