山羊痘病毒A6L基因的克隆及序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第8期北京时间：

作者：赵银龙, 吴国华, 朱海霞, 吴健, 颜新敏, 赵志荀, 李健, 吴娜, 穆晓峰, 张强

单位：中国农业科学院兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学国家重点实验室, 农业部畜禽病毒学重点开放实室验, 兰州 730046

摘要：为了分析山羊痘病毒A6蛋白的分子特征,本试验提取了山羊痘病毒古浪分离株的基因组DNA,设计引物进行PCR扩增,克隆A6L基因的DNA序列。将PCR产物连接到pGEM-T Easy载体后转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞,筛选阳性克隆进行序列测定,利用生物信息学软件对A6L基因序列进行预测分析。结果显示,A6L基因序列含有1个由1128个核苷酸组成的开放阅读框,编码375个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质分子质量的理论值为43.68 ku,理论等电点为7.50。该蛋白的二级结构中,α螺旋占53.30%,β折叠占10.24%,其余39.46%为无规则卷曲。多序列比对分析结果显示,不同羊痘病毒分离株A6L序列高度保守,同源性在97%以上。上述研究结果为进一步研究A6蛋白的生物学功能和羊痘病毒早期蛋白的分子相互作用奠定了基础。

关键词：山羊痘病毒;A6L基因')">A6L基因;基因克隆;序列分析

基金资助：国家质检总局公益性行业科研专项(201310093);国家自然科学基金(31201892);甘肃省自然科学基金(1208RJZA101);国家863计划(2012AA101304)