ITS2基因;种系发育分析">
《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:梅雪芳, 李树清, 胡长红, 黄腾飞, 陈志飞, 黄维义
单位:1. 广西大学动物科技学院, 南宁 530005;2. 上海出入境检验检疫局, 上海 200135;3. 罗氏诊断产品(上海)有限公司, 上海 200335
摘要:本试验将从犬猫肠道中分离的钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫用盐酸卡红染色后观察其形态学特征;PCR扩增其ITS2基因序列并测序,并将测序结果与GenBank同属异形科的多棘单睾吸虫和横川后殖吸虫序列进行比对;应用Mega 6.05软件采用邻位相连法构建种系发育树进行分析。盐酸卡红染色后显示,钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫各形态学特征符合经典的分类学描述。PCR测序后获得钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫ITS2序列长度分别为295和297 bp,G+C含量分别为49.5%(146/295)和54.2%(161/297)。提交至GenBank后获得登录号分别为钩棘单睾吸虫KJ137221~KJ137223,KP165437~KP165439;扇棘单睾吸虫KP165440。序列比对结果显示,钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫种内差异性为0,4种异形吸虫种间差异为15.2%~28.9%。基于ITS2序列建立的种系发育树显示钩棘单睾吸虫和扇棘单睾吸虫构成自展值为78%的拓扑分支。
关键词:钩棘单睾吸虫;扇棘单睾吸虫;ITS2基因')">ITS2基因;种系发育分析
基金资助:上海出入境检验检疫局科研项目(HK002-2014);国家质检总局科技专项(2010IK013)