版纳微型猪近交系白细胞介素6基因克隆、生物信息学及组织表达分析

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第8期北京时间：

作者：王配, 陈园园, 霍金龙, 霍海龙, 王淑燕, 潘伟荣, 成文敏, 查星琴, 曾养志

单位：1. 云南农业大学, 云南省版纳微型猪近交系重点实验室, 昆明 650201;2. 云南农业大学动物科学技术学院, 昆明 650201;3. 云南农业职业技术学院畜牧兽医系, 昆明 650031

摘要：白细胞介素6(IL-6)是机体重要的免疫调节因子,在佐剂的应用方面具有很好的发展前景。本研究以版纳微型猪近交系(BMI)为实验动物,通过PCR法获得IL-6基因编码区序列,提交GenBank数据库,登录号为JQ839263。对BMI IL-6基因和相应的蛋白序列进行了生物信息学分析,结果显示该基因编码212个氨基酸,分子质量为23.88 ku,等电点(pI)为6.66,存在一个保守结构域,一个跨膜结构,N端和C端均疏水,且在N端存在信号肽,有89%的可能性定位于细胞核。将BMI的IL-6基因编码区序列与NCBI下载到的4条猪IL-6基因序列进行比对,结果显示BMI IL-6与GenBank登录号为NM_214399和DQ832259的核苷酸序列完全相同,与GenBank登录号为AF309651和AF518322的核苷酸序列各存在1处碱基差异;多物种氨基酸序列比对及系统进化分析结果表明,BMI与骆驼亲缘关系最近。同时利用半定量PCR法确定了IL-6基因mRNA在BMI 12个组织中的表达量,结果发现在肺脏、皮肤、肌肉中表达量较高。本研究为进一步研究猪IL-6基因的表达调控奠定了理论基础。

关键词：版纳微型猪近交系;白细胞介素6;免疫调节;基因克隆;组织表达

基金资助：国家自然科学基金(31160439、31460580);云南省教育厅科学研究基金项目(2011C191)