猪嵴病毒VP0基因的克隆与序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第9期北京时间：

作者：陈如敬, 修金生, 陈晓珞, 吴学敏, 车勇良, 王晨燕, 严山, 王隆柏, 周伦江

单位：1. 福建省农业科学院畜牧兽医研究所, 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心, 福州 350013;2. 福建农林大学动物科学学院, 福州 350002;3. 龙岩市康顺养殖有限公司, 龙岩 364000

摘要：本研究根据猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)VP0基因序列特征设计特异性扩增引物,采用RT-PCR方法扩增猪嵴病毒VP0基因全长编码区。将特异性扩增目的片段克隆后进行序列测定,将结果进行拼接后获得猪嵴病毒VP0基因全长并进行相关生物信息学分析。所扩增的目的片段编码有完整的VP0基因开放阅读框,全长为1 098 bp,编码有366个氨基酸,理论等电点为6.71,理论分子质量为38.489 ku,不稳定系数为34.65,最大疏水指数为2.622,最小疏水指数为—2.122。将获得的VP0基因和GenBank中的猪嵴病毒代表株VP0基因序列进行核苷酸同源性比对和遗传进化分析,其与HNXX-4核苷酸同源性最高,为89.1%,与S-1-HUN核苷酸同源性最低,为81.1%。从遗传进化上看,猪嵴病毒VP0基因在遗传进化上呈两个独立的基因亚群,猪嵴病毒中国分离株在两个遗传基因亚群上均有分布。

关键词：猪嵴病毒;VP0基因')">VP0基因;克隆;序列分析

基金资助：福建省属公益类科研专项(2014R1102、2013R1025-8)