《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

副猪嗜血杆菌丝氨酸蛋白酶基因的克隆及生物信息学分析

来源:中国畜牧兽医杂志2015年第10期北京时间:

作者:游锦洲, 张瑞振, 丘建龙, 谢敏, 胡玲英

单位:1. 龙岩出入境检验检疫局, 龙岩 364000;2. 福建农林大学动物科学学院, 福州 350002

摘要:为研究副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)丝氨酸蛋白酶(espP)作为疫苗候选抗原的可能性,根据GenBank中Hps espP基因(登录号:HAPS_1381)设计引物,以Hps血清11型(H456)菌株的DNA为模板,PCR扩增目的基因并测序。将该基因核苷酸序列翻译成氨基酸序列后,对Hps espP蛋白的信号肽、亲水性区域和B细胞抗原表位进行预测,并预测了该蛋白C端的3D结构。结果显示,Hps espP基因序列全长2 343 bp,共可编码781个氨基酸,其中氨基酸序列的1—23位预测为信号肽。Hps espP蛋白含有12个亲水性区域,并预测含有12个B淋巴细胞抗原表位。构建Hps espP蛋白3D结构显示,该蛋白C端是由12个β折叠层围成的桶状结构。本试验为进一步研制新型副猪嗜血杆菌Hps espP蛋白多肽疫苗奠定基础。

关键词:副猪嗜血杆菌;丝氨酸蛋白酶;克隆;生物信息学

基金资助:福建省科技厅省属高校项目(JK2011052)

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