五指山猪FUT1基因SNP检测及生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2015年第11期北京时间：

作者：晁哲, 王峰, 黄丽丽, 刘海隆, 孙瑞萍, 郑心力

单位：海南省农业科学院畜牧兽医研究所, 海口 571100

摘要：为获得五指山猪FUT1基因序列并分析其基因结构,检测FUT1基因中的单核苷酸多态性(SNP)位点在五指山猪群体中的分布情况,本试验利用PCR扩增猪FUT1基因组序列,通过基因测序寻找该基因中的SNP位点,使用PCR-RFLP方法对120头五指山猪进行了FUT1基因型检测,并运用生物信息学方法对FUT1基因序列进行分析。在猪FUT1基因组中共发现两个单碱基突变,分别位于编码区(A+307G)和3'非翻译区(A+1856C);在FUT1基因A+307G突变位点上,五指山猪均为GG基因型;此外,FUT1基因启动子区域和第2外显子处存在CpG岛。本研究成功获得五指山猪FUT1基因序列信息,为下一步五指山猪FUT1基因的功能研究奠定基础。

关键词：五指山猪;FUT1基因')">FUT1基因;多态性;生物信息学分析

基金资助：国家"863"项目(2011AA100302);海南省科学事业费项目(13-214002-0001);海南省省属科研院所技术开发研究专项(KYYS-2015-02);海南省农业科学院农业科技创新专项经费项目(CXZX201414)