青海高原牦牛PRDM16基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第2期北京时间：

作者：赵生军, 张勇, 郭宪

单位：1. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所, 甘肃省牦牛繁育工程重点实验室, 兰州 730050;2. 甘肃农业大学动物医学院, 兰州 730070

摘要：本研究对青海高原牦牛PRDM16 (PR domain containing 16)基因部分编码区进行克隆及生物信息学分析,同时对PRDM16基因在雌、雄牦牛背最长肌肌肉组织中的表达差异进行了分析.选取雌、雄青海高原牦牛各5头,屠宰后采集背最长肌肌肉组织,克隆牦牛PRDM16基因部分CDS区序列,分析其生物信息学特征;应用实时荧光定量PCR技术检测PRDM16基因在雌、雄牦牛肌肉组织中表达水平.结果显示:克隆所得片段序列长323 bp,与黄牛同源性为100%,编码99个氨基酸,具有MDS1-EVI1(complex locus protein MDS1)家族蛋白功能,具有CATH蛋白功能活性,包含卷曲螺旋等典型结构域,与人甲基转移酶蛋白结构域PR蛋白1有20%的相似性;PRDM16基因在雌性牦牛肌肉组织中表达水平极显著高于雄性牦牛(P<0.01).本试验结果为进步一研究青海高原牦牛PRDM16基因奠定了基础,为牦牛肉品质分析提供参考.

关键词：青海高原牦牛;PRDM16基因')">PRDM16基因;背最长肌;基因表达

基金资助：国家自然科学基金(31301976);国家科技支撑计划项目子课题(2013BAD16B09);现代农业(肉牛牦牛)产业技术体系建设专项(CARS-38)