贵州省猪流行性腹泻病毒ORF3、M基因克隆及序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第2期北京时间：

作者：冯旭芳, 周碧君, 张双翔, 王跃章, 文明, 程振涛, 毛黎红, 王开功

单位：1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州省生猪质量安全工程技术研究中心, 贵阳 550025;3. 贵州省动物疫病预 防控制中心, 贵阳 550001;4. 贵州都匀市黔昌畜牧发展有限责任公司, 都匀 558000;5. 花溪区农业局, 贵阳 550025

摘要：为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3及M基因的遗传变异情况,试验于2014年4月－2015年3月从贵州省5个地区采集105份腹泻仔猪的粪便,应用RT-PCR方法进行PEDV检测,从中选择8份PEDV阳性样本,扩增其ORF3及M基因,测序并进行序列比对分析.结果显示,从采集的105份粪便样本中可检出75份PEDV阳性样本,阳性率为71.43%;8株PEDV贵州株ORF3及M基因序列均无碱基缺失或插入;ORF3基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在95.1%~100.0%与95.1%~99.6%之间,M基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在98.4%~100.0%与98.7%~100.0%之间;氨基酸系统进化树分析结果显示,2014~2015年贵州流行株与近年来中国毒株、韩国毒株及泰国毒株亲缘关系较近,与疫苗株Attenuated DR13及CV777株亲缘关系较远.提示目前贵州省仔猪腹泻病原主要是PEDV,且为PEDV强毒株.

关键词：猪流行性腹泻病毒;ORF3基因')">ORF3基因;M基因')">M基因;克隆;序列分析

基金资助：贵州省生猪质量安全工程技术研究中心建设项目"生猪健康养殖实验室建设与技术研发"(黔科合农C字[2011]4022号);贵州省科学技术厅农业攻关项目"贵州省仔猪腹泻性疫病风险分析及综合防控技术研究"(黔科合NY[2015]3009-1号);"贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队"(黔科合人才团队[2015]4016号);贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室培育(黔科合计Z字[2011]4008号);贵州省农业委员会科技计划项"贵州省2015年重大动物疫病省级定点监测"(2015-