中国北方绵羊基因组拷贝数变异研究

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第3期北京时间：

作者：侯成林, 王伟, 周欢敏, 张焱如, 曹俊伟

单位：1. 内蒙古农业大学生命科学学院, 呼和浩特 010018;2. 包头轻工职业技术学院, 包头 014030

摘要：为寻找绵羊基因组中可能的遗传性状相关标记,本试验采用比较基因组杂交(comparative genomic hybridization,CGH)芯片技术,构建了蒙古羊、哈萨克羊、藏羊的拷贝数变异(copy number variation,CNV)多样性图谱。试验结果显示,共检测出28个CNV区域(CNV region,CNVRs),包括11个扩增型、15个缺失型和2个扩增—缺失型。通过功能注释和代谢通路分析发现,在蒙古羊和藏羊基因组中血红蛋白基因存在拷贝数扩张,可能与两种绵羊长期生活在高原低氧环境中产生的适应性有关。对CNVRs和CNV相关基因进行实时荧光定量PCR检验,83.3%的实时荧光定量PCR结果与芯片检测结果一致。通过对中国北方3种绵羊的基因组CNV的研究,为不同绵羊品种间遗传变异的研究奠定了基础。

关键词：绵羊;拷贝数变异;比较基因组杂交;实时荧光定量PCR

基金资助：内蒙古农业大学校内基金