5个猪品种3个拷贝数变异区的多态性分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第3期北京时间：

作者：黄世会, 冉雪琴, 王嘉福, 潘华, 李蓉蓉

单位：1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学农业生物工程研究院, 贵阳 550025

摘要：为了探究拷贝数变异(copy number variation,CNV)在不同猪品种间的多态性,本试验根据猪SNP60芯片检测结果,以大白猪、香猪、柯乐猪、糯谷猪、荣昌猪为主要研究对象,采用实时荧光定量PCR方法,对5个猪品种基因组中3个CNV区域(CNVR91、CNVR92和CNVR143)的拷贝数进行测定。结果显示,香猪的CNVR91以拷贝数缺失为主,其他4个猪品种的拷贝数以正常为主;香猪、大白猪、柯乐猪、荣昌猪的CNVR92以拷贝数缺失为主,糯谷猪以拷贝数正常为主;香猪和糯谷猪的CNVR143以拷贝数增加为主,其他3个猪品种以拷贝数正常为主。表明3个拷贝数变异区在5个猪品种之间具有多态性,可能通过剂量效应影响香猪、糯谷猪和柯乐猪等相关基因的表达和生理功能。

关键词：拷贝数变异;猪品种;实时荧光定量PCR;多态性

基金资助：国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2013AA102503);贵州省农业科技攻关项目(黔科合NY[2013]3073号);贵州省科技创新人才团队建设专项(黔科合人才团队2009-4006);贵州大学"本科教学工程"项目(BKJX2012007)