水牛浮舰蛋白2基因克隆及序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第4期北京时间：

作者：段安琴, 庞春英, 朱鹏, 邓廷贤, 陆杏蓉, 梁贤威

单位：中国农业科学院广西水牛研究所, 广西水牛遗传繁育重点实验室, 南宁 530001

摘要：试验旨在克隆水牛浮舰蛋白2(Flotillin 2,FLOT2)基因并对其进行生物信息学分析,为揭示该基因在水牛发育繁殖中的作用奠定基础。本研究通过PCR扩增获得了FLOT2基因全长并进行克隆测序,结合生物信息学分析方法,预测及分析其蛋白质结构。结果表明,水牛FLOT2基因编码区长1 287 bp,编码428个氨基酸,3'UTR区长277 bp。多重序列比较分析显示,水牛FLOT2基因核苷酸序列与牛、山羊、绵羊、小鼠、马、猫和人相应序列的相似性分别为98%、98%、97%、90%、93%、92%和92%,系统进化树分析结果表明,FLOT2基因在不同物种以及进化的过程中具有高度保守性。对FLOT2蛋白质的分析表明,该蛋白呈弱酸性,无信号肽,细胞亚定位于细胞质中,存在SPFH_flotillin和SPFH_hflk等结构域。microRNA预测结果表明,bta-miR-2438、bta-miR-2379和bta-miR-1777a可能是其3'UTR潜在靶标。研究结果为今后阐明FLOT2基因在水牛繁殖性能中的功能,尤其是在配子及胚胎发生过程中的作用及分子机制奠定了基础。

关键词：水牛;浮舰蛋白2基因;克隆;分析

基金资助：农业部转基因重点项目(2014ZX0801012B);桂科合(14123001-5);水牛基(1504005)