基于芯片数据和整合分析研究奶牛乳房炎的关键通路

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第4期北京时间：

作者：赵静, 陈振亮, 王振, 张哲, 肖倩, 管毓渝, 孙浩, 刘光磊, 张向喆, 潘玉春, 廖荣荣, 王起山

单位：1. 上海交通大学农业与生物学院, 上海 200240;2. 上海市兽医生物技术重点实验室, 上海 200240;3. 上海光明荷斯坦牧业有限公司, 上海 200246;4. 上海奶牛育种中心股份有限公司, 上海 200246;5. 上海市农业科学院畜牧所, 上海 200246

摘要：奶牛乳房炎是奶牛的常见病和多发病之一,给奶牛业带来巨大的经济损失,严重制约着奶牛业的发展。为了进一步了解乳房炎的调控机理,对已发表的5套大肠杆菌感染奶牛乳腺上皮细胞的表达谱芯片数据统一进行预处理,并整合大肠杆菌感染1、6、24 h的基因富集分析,以期得到更可靠的影响奶牛乳房炎的关键基因和通路。结果发现,感染1、6和24 h数据集的分析结果中共同下调通路分别为9、30和17个,分析结果确定了一些奶牛乳房炎相关的通路及基因,为进一步揭示其调控机理提供参考。

关键词：奶牛;乳房炎;基因富集分析;通路

基金资助：上海市农委科技兴农攻关项目——基因组高密度SNP分子标记技术开发利用(沪农科攻字(2012)第2-3号)和南方大城市奶牛健康养殖生产技术集成及产业化示范(2012BAD12B08)