香猪SNP位点rs80894395的多态性及其与体尺指标之间的关联研究

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第5期北京时间：

作者：王洋, 梅子凌, 喻昌燕, 牛熙, 谢玲玲, 牛秋锦, 仇志浪, 王嘉福, 冉雪琴

单位：1. 贵州大学生命科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学农业生物工程研究院, 贵阳 550025;3. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025

摘要：为了探究影响香猪生长发育的功能基因,本试验利用Illumina Porcine SNP60K芯片筛选出N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2,GALNT2)基因内含子10中一个与腹围呈弱相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs80894395。在此基础上应用等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)技术检测520头雌性香猪群体中该位点的基因型,并与43头大白猪、36头柯乐猪相比较。结果表明,从3个猪群体中检测到rs80894395位点的CC、CT和TT3种基因型;其中香猪群体以CT为优势基因型,且基因型与香猪的体重、体长和腹围呈弱的正相关;大白猪群体以CC基因型为主,T等位基因频率较香猪极显著减少(P0.05)。生物信息学分析表明,rs80894395位点可能影响GALNT2基因的剪接过程。rs80894395与香猪的生长发育可能有一定的联系。

关键词：香猪;体尺;内含子剪接;SNP;GALNT2基因')">GALNT2基因

基金资助：国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2013AA102503);贵州省农业攻关项目(黔科合NY[2013]3073号);贵州省科技创新人才团队建设专项(黔科合人才团队2009-4006);贵州大学"本科教学工程"项目(BKJX2012007);贵州大学研究生创新基金"乙酰氨基半乳糖转移酶基因多态性研究"(研农2015018)