《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:轩俊丽, 马晓萌, 袁泽湖, 胡师金, 王慧华, 魏彩虹, 赵福平, 张莉, 杜立新
单位:1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193;2. 甘肃农业大学动物科学技术学院, 兰州 730070
摘要:为了探讨绵羊味觉受体第一家族(taste receptor family 1 member,T1R)基因外显子多态性及其基因型在乌珠穆沁羊和湖羊群体中分布的差异性,试验采用DNA池直接测序及飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)法对中国蒙古系两个绵羊品种共172个个体T1Rs基因外显子的遗传变异情况进行分析,利用生物信息学软件预测多态位点对T1Rs基因mRNA二级结构和蛋白质二级结构的影响。结果表明,在两个群体的T1R家族基因中筛查到9个SNPs。独立性卡方检验显示有5个多态位点基因型的分布在两个绵羊群体中存在显著性差异(P<0.05),分别为TAS1R1基因上的SNP2,TAS1R2基因上的SNP4、SNP7和SNP8,TAS1R3上的SNP10,其中,SNP2、SNP7和SNP10为同义突变;SNP2和SNP10导致相应基因mRNA二级结构和最小自由能的改变,而SNP7仅导致TAS1R2基因最小自由能发生改变;SNP4和SNP8为错义突变,分别导致TAS1R2蛋白质中第379位天冬酰胺变为丝氨酸和第701位苏氨酸变成蛋氨酸,且突变前后受体蛋白的二级结构均发生改变。
关键词:绵羊;味觉受体基因;多态性;生物信息学
基金资助:“十二五”863项目“绵羊全基因组关联分析研究”(2011AA100307-02)