水牛Keap1基因的克隆、序列分析及组织表达研究

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第8期北京时间：

作者：赵鑫, 阮子芸, 郭振伟, 周文婷, 秦希玲, 牛向丽, 陆凤花, 石德顺

单位：广西大学, 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 南宁 530004

摘要：本研究克隆了水牛Keap1基因的全长编码区，并对其序列进行了生物信息学分析，同时探索了其在水牛各组织中的表达差异。根据GenBank中公布的牛Keap1基因的序列信息，设计特异性引物并扩增出水牛Keap1的目的片段，利用生物信息学分析方法，对测序所得水牛Keap1基因序列、预测蛋白质序列进行了分析，并采用实时荧光定量PCR技术对Keap1基因mRNA在水牛各组织中的表达进行了研究。结果表明，水牛Keap1基因编码区全长1 875 bp，预测编码624个氨基酸；多重分析结果显示，水牛与牛、绵羊、野猪和人Keap1基因的同源性分别为99%、96%、92%和90%；进化树分析表明Keap1在物种间具有较高保守性，不同物种间Keap1序列的差异符合物种间的进化性。对Keap1蛋白质二级结构预测发现，其包含24个α-螺旋、40个β-螺旋、38个T转角和27个无规则卷曲。实时荧光定量PCR结果显示，Keap1基因在水牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢和肌肉组织中均有表达，但心脏中表达量最高，肝脏、脾脏中表达量较低。本研究成功克隆了水牛Keap1基因，并进行了相关生物信息学分析及其mRNA在水牛各组织的表达情况研究，为阐明Keap1-Nrf2-ARE信号通路，提高水牛胚胎体外培养的抗氧化能力奠定基础。

关键词：水牛;Keap1基因')">Keap1基因;克隆;分析;表达

基金资助：国家高技术研究发展计划“863”项目（2011AA100607）；国家自然科学基金项目（31560633）；广西科学基金（2012GXNSFFA060004）；广西研究生教育创新计划项目（YCBZ2015004）；广西计生委科研项目（桂人口计生研1109）