畜禽长链非编码RNA的功能及其研究方法

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第9期北京时间：

作者：陆启荣, 刘孟轲, 李丽, 程古月, 郝海红, 王旭, 戴梦红, 袁宗辉

单位：华中农业大学动物医学院, 国家兽药残留基准实验室(HZAU), 农业部畜禽产品质量安全风险 评估实验室(武汉), 农业部兽药残留检测重点开放实验室, 武汉 430070

摘要：长链非编码RNA（long noncoding RNA，LncRNA）是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子，不具有编码蛋白质的能力，主要参与脂肪代谢、肌肉发育、胚胎发育、性别决定与分化等多种生物过程和疾病的调控。在LncRNA研究中，研究方法的建立和应用起着至关重要的作用。作者简述了LncRNA的生物学特性和生物学功能，重点介绍了LncRNA的主要研究方法：基因芯片、RNA-seq、Northern blotting、荧光原位杂交（FISH）、实时荧光定量PCR、RNA结构平行分析（PARS）、快速预测RNA和蛋白质相互作用（CatRAPID）等，同时介绍了LncRNA与DNA、RNA及蛋白质的相互作用的方法：RNA-pulldown、RNA结合蛋白免疫沉淀（RIP）、光活性增强的核糖核苷交联和免疫共沉淀（PAR-CLIP）、RNA反义纯化（RAP）、RNA纯化的染色质分离（CHIRP）及RNA靶标的捕获杂交分析（CHART）、交联，连接以及混合测序（CLASH），为畜禽动物中LncRNA的研究提供借鉴。

关键词：长链非编码RNA;畜禽;生物学功能;研究方法

基金资助：国家高技术研究发展计划（863计划：2011AA10A214）