水牛瘦素基因单核苷酸多态性分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第9期北京时间：

作者：庞春英, 邓廷贤, 陆杏蓉, 朱鹏, 段安琴, 梁贤威

单位：中国农业科学院广西水牛研究所, 农业部(广西)水牛遗传繁育重点实验室, 南宁 530001

摘要：试验旨在检测水牛瘦素（Leptin）基因序列的多态性，为进一步开展水牛标记辅助育种研究奠定基础。运用DNA混合池结合直接测序及高分辨熔解曲线（HRM）法在182头奶水牛个体中进行Leptin基因SNP位点的筛选和分型。结果表明，在试验群体中Leptin基因共发现7个SNPs，位于内含子1、内含子3和外显子3区域，分别是A3123G、A3776G、A4154G、A5228G、A5524C、G5573T和A5751C。除了SNP5和SNP6位点在尼里－拉菲水牛群体中的多态信息含量（PIC）属于低度多态之外，所有SNPs位点在3个水牛群体中均属于中度多态。经χ2检验，所有SNPs位点的突变在尼里－拉菲水牛群体均达到Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。本研究成功筛查7个水牛Leptin基因SNPs位点并进行了基因分型，为下一步开展奶水牛Leptin基因的标记－性状关联分析奠定基础。

关键词：水牛;瘦素基因;多态性;基因分型

基金资助：广西科技攻关国际交流与合作项目（桂科合14123001-5）；广西水产畜牧兽医局科技项目（桂渔牧科201452032）；广西自然科学基金重点项目（2014GXNSFDA118017）