细毛羊LAMB1基因外显子多态性及其与羊毛纤维直径的关联性分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第9期北京时间：

作者：赵冰茹, 黄锡霞, 田可川, 付雪峰, 徐新明, 柏妍, 田月珍

单位：1. 新疆农业大学动物科学学院, 乌鲁木齐 830052;2. 新疆畜牧科学院, 乌鲁木齐 830000

摘要：试验旨在研究LAMB1基因外显子在细毛羊中的多态性及其与羊毛纤维直径的关联性。基于DNA池重测序技术获得的SNPs数据，共筛选LAMB1基因外显子区域20个SNPs，利用直接测序法、PCR-SSCP及生物信息学软件对10个错义突变SNPs的准确性进行验证，利用SAS 8.1的GLM程序分析其对新疆巩乃斯种羊场育种核心群300只细毛羊的遗传效应及与被毛纤维直径的关联性。结果表明，20个SNPs中10个是同义突变SNPs；10个错义突变SNPs验证后7个发生错义突变，导致蛋白性质改变，3个呈假阳性。突变后LAMB1蛋白疏水性更强，预测是不可溶性蛋白。SNP5中TT基因型个体纤维直径显著高于TC和CC基因型个体（P<0.05），SNP9中GG和TT基因型个体纤维直径显著高于GT基因型个体（P<0.05）。虽然DNA混池全基因组重测序技术完整地检测到基因的SNPs，并将假阳性最小化，但还需要对结果进行验证。研究揭示LAMB1基因外显子多态性丰富，突变SNPs在外显子中分布不平衡，LAMB1基因SNP5（rs159769941）和SNP9（rs159769901）可以考虑作为影响细毛羊被毛纤维直径的有效遗传标记。

关键词：DNA混池;重测序;LAMB1基因')">LAMB1基因;SNPs

基金资助：国家自然科学基金（31360543、31460593）；农业部体系项目（CARS-40）；新疆农业大学产学研联合培养研究生示范基地项目（xjaucxy-yjs-20152012）