猪MAP3K5基因CDS序列克隆及生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第10期北京时间：

作者：蒲蕾, 岳静伟, 张金山, 刘欣, 王立刚, 颜华, 侯欣华, 高红梅, 张恬, 张跃博, 武群清, 张龙超, 王立贤

单位：1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 北京 100193;2. 天津农学院动物科学与动物医学学院, 天津 300384;3. 湖南农业大学动物科学技术学院, 长沙 410128

摘要：试验克隆了猪MAP3K5基因cDNA序列，分析了猪MAP3K5基因与MAP3K家族及其他物种MAP3K5基因的序列同源性，并研究了其保守结合域。通过RACE-PCR扩增获得猪MAP3K5基因5 452 bp的序列，并分析其可能的开放阅读框及预测蛋白序列，获得了MAP3K5基因31个外显子结构。通过比对发现，猪MAP3K5基因与MAP3K家族其他成员的mRNA及蛋白质序列的同源性较低，均在50%以下，其中猪MAP3K5与MAP3K6基因序列的同源性相对较高；猪MAP3K5基因与其他物种的MAP3K5基因的mRNA及蛋白质序列的同源性较高，均在78%以上，其中猪MAP3K5基因与牛、绵羊、犬和人的MAP3K5基因序列的同源性较高。对与猪MAP3K5序列同源性更高的蛋白质进行保守结构域分析，发现MAP3K6与MAP3K5的保守域和结合位点类似，其他MAP3K家族成员与MAP3K5的结构域差别较大；而其他物种的MAP3K5与猪MAP3K5相比保守结构域和结合位点相似。结果初步表明了猪MAP3K5序列和结构域特点，可为后续MAP3K5基因的功能研究奠定基础。

关键词：猪;MAP3K5基因')">MAP3K5基因;序列比对;结构域

基金资助：中国农业科学院科技创新工程（ASTIP-IAS02）；国家“十二五”科技支撑计划项目（2015BAD03B02-2）；国家现代农业产业技术体系（CARS-36）