禽呼肠孤病毒σB和σC蛋白二级结构及其细胞抗原表位预测

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第11期北京时间：

作者：黄莉, 谢芝勋, 谢丽基, 邓显文, 谢志勤, 范晴, 罗思思, 黄娇玲, 曾婷婷, 张艳芳, 王盛

单位：广西壮族自治区兽医研究所, 广西重点实验室, 南宁 530001

摘要：研究旨在运用DNAStar生物软件及Garnier-Robson、Chou-Fasman等方法分析禽呼肠孤病毒（avian reovirus，ARV）标准毒株S1133重要结构蛋白σB和σC的二级结构及其T细胞和B细胞抗原表位。通过分析其亲水性、柔韧性、表面可及性和抗原指数等特性，对σB和σC蛋白的B细胞抗原表位进行预测；以Rothbard-Taylor和AMPHI方法预测σB和σC蛋白的T细胞抗原表位。结果显示，σB和σC蛋白形成α-螺旋结构的能力较差，但与σB蛋白相比，σC蛋白含有较多的β-折叠结构、转角及无规则卷曲等二级结构，因而σC蛋白二级结构较复杂。分析结果还表明σB和σC蛋白均含有潜在B细胞和T细胞抗原表位，尤其是σC蛋白具有较多的B细胞和T细胞抗原表位。本试验为深入研究σB和σC蛋白的免疫学特性及研发ARV新型疫苗和药物靶标奠定基础。

关键词：禽呼肠孤病毒;σB和σC结构蛋白;二级结构;抗原表位

基金资助：广西自然科学基金（2014GXNSFCA118006）；广西水产畜牧兽医局科技项目（桂渔牧科201452003）