可乐猪乳头数性状全基因组关联分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第11期北京时间：

作者：谢健, 喻昌燕, 许瑶, 牛熙, 冉雪琴, 王嘉福

单位：1. 贵州大学生命科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学农业生物工程研究院, 贵阳 550025;3. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;4. 铜仁学院, 铜仁 554300

摘要：乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一，与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP 60K芯片对22头可乐猪进行基因分型，通过Plink 1.07软件，基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经过严格的质量控制和多重检验之后，共鉴定出全基因组水平潜在关联的SNPs位点4个（P<2.06E-5）；染色体水平显著关联位点3个，潜在关联位点18个；在关联SNP位点可能连锁的上、下游1 cM区间内检索到304个基因，其中Wnt及Fgf信号通路中的候选基因BTRC、FGF5、FGF8和BMP3、RASGEF1B、HMGB3可能影响猪的乳头数性状或繁殖性状。通过全基因组关联分析策略发掘出的关联SNP位点及潜在候选基因，将为可乐猪的选育保种奠定基础。

关键词：SNP芯片;全基因组关联分析;乳头数

基金资助：国家高技术研究发展计划（863计划）课题（2013AA102503）；贵州大学创新基金（2015009）；贵州省农业攻关项目（黔科合NY[2013]3073号）；贵州省科技创新人才团队建设专项（黔科合人才团队2009-4006）；贵州大学本科教学工程项目（BKJX2012007）