牛乳头状瘤病毒贵州株L1基因克隆及生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第11期北京时间：

作者：张海, 周碧君, 杨忠成, 廖梅, 王开功, 文明, 程振涛, 王伟, 冯旭芳

单位：1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州省动物疫病研究室, 贵阳 550025;3. 贵州省畜禽遗传资源管理站, 贵阳 550001

摘要：为分析牛乳头状瘤病毒贵州株（BPV-GZ01株）L1基因的分子特征，预测其编码蛋白的生物学功能，本试验对BPV-GZ01株L1基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学相关软件及方法对BPV-GZ01株L1基因进行序列分析，并对其编码蛋白进行二级结构、三级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。结果显示，L1基因序列全长为1 494 bp，编码497个氨基酸；与BPV2、BPV2-SW01、BPV2-AKS01、BPV13、BPV1株相应序列核苷酸同源性分别为99.1%、99.8%、99.4%、87.6%和82.8%，氨基酸同源性分别为98.6%、99.4%、98.4%、94.4%和91.3%；系统进化树显示，BPV-GZ01株与BPV2-SW01株亲缘关系最近；L1蛋白二级结构以无规则卷曲、β-折叠和α-螺旋区域所占比例较大，预测此蛋白可能存在6个B细胞优势抗原表位，无跨膜区域，无信号肽区域；三级结构呈弯曲状螺旋结构。本研究结果将为贵州省BPV免疫诊断及核酸疫苗研究提供理论依据。

关键词：牛乳头状瘤病毒;L1基因')">L1基因;生物信息学分析;蛋白结构预测

基金资助：贵州省农业委员会科技专项《动物疫病防控能力提升专项》（黔农财[2015]149号）；贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队（黔科合人才团队[2015]4016号）；贵州省黔南州社会发展科技重大计划项目《喀斯特石漠化林草牧综合治理技术研究与示范》[黔南社发科（20140325）]；贵州现代肉牛产业技术体系专项（GZCYTX2015-0302-02）