猪圆环病毒2型山西株全基因组序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2016年第12期北京时间：

作者：孟帆, 吴忻, 姚敬明, 樊振华, 刘文俊, 王娟萍, 韩一超, 薛翼鹏, 米瑞娟, 李玉斌

单位：1. 山西省农业科学院畜牧兽医研究所, 太原 030032;2. 陵川县畜牧兽医局, 晋城 048300

摘要：为了解山西省猪圆环病毒2型（PCV2）的遗传变异情况，本试验采用PCR方法对山西省分离的4株猪圆环病毒流行株（SXXZ1株、SXXZ2株、SXTY株和SXJZ株）的全基因组进行了扩增、克隆和测序，并将其全基因组序列与国内外34株主要流行毒株进行核苷酸同源性与系统进化树分析。结果显示，4株PCV2山西流行株全基因组核酸序列全长SXJZ株为1 768 bp，其余均为1 767 bp，分别占25%和75%。4株毒株核苷酸同源性为95.9%~100.0%，与国内外34株参考株同源性为94.5%~99.9%，与国产疫苗株同源性为95.6%~99.8%；PCV2全基因组序列进化分析表明，本研究分离的SXXZ1株、SXXZ2株和SXTY株属于PCV-2b基因型，SXJZ株属于PCV-2e基因型，其中SXXZ1株和SXXZ2株与广东QY株的进化关系最近，SXTY与奥地利AUT5株的进化关系最近，SXJZ与福建FJ株的进化关系最近；而SXXZ1株、SXXZ2株和SXTY株与山西PCV2疫苗DBN-SX07-2株的进化关系较近，SXJZ株与国内PCV2疫苗LG株的进化关系较近。从而证实在山西省流行的PCV2毒株以PCV-2b为主，同时还分离出了PCV-2e亚型，表明山西省存在PCV-2e亚型毒株。本试验结果为山西省PCV2的分子流行病学、遗传变异及防控奠定了基础。

关键词：猪圆环病毒2型;全基因组;序列分析

基金资助：山西省科技攻关项目（20130311026-4）