绵羊痘病毒固原株L2R基因的克隆与生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第1期北京时间：

作者：李杨, 颜新敏, 吴国华, 李健, 叶奕优, 赵志荀, 朱海霞, 张强

单位：1. 中国农业科学院兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学国家重点实验室, 兰州 730046;2. 深圳出入境检验检疫局, 动植物检验检疫技术中心, 深圳 518045

摘要：为分析绵羊痘病毒L2R蛋白的分子特征，本试验提取了绵羊痘病毒固原株（GY）的基因组DNA，设计L2R基因引物，对L2R基因进行扩增，将扩增的基因连接到pGEM-T Easy载体后转化到大肠杆菌Trans 5α感受态细胞，筛选阳性克隆，进行序列测序。利用生物信息学软件对L2R基因序列进行预测分析。结果显示，L2R基因序列含有一个由279个核苷酸组成的开放阅读框，编码92个氨基酸残基组成的多肽，蛋白质分子质量理论值为10.92 ku，理论等电点为6.56。该蛋白质二级结构组成分别是α-螺旋占69.57%，β-折叠占9.78%，无规则卷曲占8.70%，延伸链占11.96%。多序列比对分析结果显示，不同羊痘病毒分离株L2R序列高度保守。进化树分析结果显示，GY株与NK、TU及SA株在一个分支，表明它们之间亲缘关系较近。本试验结果为进一步研究L2R蛋白的生物学功能和羊痘病毒早期蛋白的分子相互作用奠定了基础。

关键词：羊痘病毒;L2R基因')">L2R基因;基因克隆;生物信息学

基金资助：国家重点研发计划课题（2016YFD0500907）；甘肃省国际科技合作专项（1604WKCA012）；甘肃省国际科技合作专项（1504WKCA055）