猪嗜淋巴细胞疱疹病毒2型GD27株gB基因生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第1期北京时间：

作者：朱事康, 佟铁铸, 刘星, 李春萍, 陈燕忠, 罗卓军, 林志雄, 刘中勇, 周宇

单位：1. 惠州出入境检验检疫局, 惠州 516006;2. 广东出入境检验检疫局, 广州 510623

摘要：试验采用PCR方法扩增出猪嗜淋巴细胞疱疹病毒2型（porcine lymphotropic herpesviruses 2，PLHV-2）gB基因全序列，并进行测序，使用生物信息学软件对gB蛋白进行生物信息学分析和预测。结果显示，gB蛋白由876个氨基酸组成，分子式为C4500H6975N1199O1351S40，分子质量为100.77 ku，等电点为6.45，不稳定系数为38.58；二级结构预测以无规则卷曲为主要结构，1-39位氨基酸为信号肽，761-780位氨基酸为跨膜区结构，具有多种功能位点，存在多处天然非规则结构蛋白；三级结构显示有一个具有溶解作用的环状构象。综合多种方法分析预测结果表明，gB基因存在多个B细胞线性抗原表位，可作为PLHV-2疫苗的候选抗原。

关键词：猪嗜淋巴细胞疱疹病毒;gB基因')">gB基因;生物信息学分析

基金资助：广东省科技厅项目（2013B020307009）