略阳乌鸡线粒体DNA控制区(D-loop)的遗传多样性分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第1期北京时间：

作者：尹亚军, 杜伟立, 王令, 张涛

单位：陕西理工大学生物科学与工程学院, 汉中 723000

摘要：为了研究略阳乌鸡线粒体DNA控制区（mtDNA D-loop）的遗传多样性和起源，本研究对30只略阳乌鸡样品的mtDNA D-loop全序列进行了PCR扩增和测序，结合GenBank中公布的其他鸡的D-loop区序列，分析略阳乌鸡线粒体多态性及其起源。结果表明，略阳乌鸡mtDNA D-loop区全序列中，A、C、G、T平均含量分别为26.6%、26.6%、13.4%和33.4%，26个核苷酸多态位点均为转换位点，核苷酸多样度（Pi）为0.00705，单倍型变异度（Hd）为1.000，中性检验Tajima's D值为-0.47272。通过群体构建的系统进化树发现，略阳乌鸡样品在系统进化树上聚为4大分支。研究结果表明，略阳乌鸡群体内个体序列变异程度较大，遗传多样性丰富，揭示略阳乌鸡在遗传组成上具有4个母系来源。

关键词：略阳乌鸡;线粒体DNAD-loop;遗传多样性

基金资助：陕西省教育厅专项科研计划项目（15JK1145）；陕西理工学院研究生创新基金（SLGYCX1520）