鸡蛔虫线粒体cox1和nad4基因的遗传变异分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第1期北京时间：

作者：郝桂英, 何学谦, 万润

单位：西昌学院动物科学学院, 西昌 615013

摘要：为探究鸡蛔虫的种内遗传变异和系统发育关系，对分离自四川省西昌市的15个鸡蛔虫分离株的线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基（cox1）基因部分序列和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位Ⅳ（nad4）基因全序列进行PCR扩增、序列测定及分析，并用cox1和nad4基因部分序列构建鸡蛔虫与其他蛔虫的NJ树和贝叶斯树。测序结果显示，所获得的鸡蛔虫cox1和nad4基因全序列长度分别为1 152和1 236 bp，分别有33和40个变异位点，碱基变异率分别为0~2.1%和0~2.3%；分别检测到8和11个单倍型，总的单倍型多样性分别为0.733±0.124和0.933±0.054，核苷酸多样性分别为0.00433±0.00153和0.00541±0.00157，平均遗传距离分别为0.004和0.005。构建的种系发育树均显示15个鸡蛔虫西昌分离株与其他国家/地区的鸡蛔虫分离株聚类形成一个分支，与鸽蛔虫的亲缘关系最近，与其他蛔虫所属的分支相隔较远。研究结果表明鸡蛔虫西昌分离株的遗传变异程度低，且nad4基因比cox1基因更适合作为研究鸡蛔虫分离株遗传变异的分子标记。

关键词：鸡蛔虫;cox1基因')">cox1基因;nad4基因')">nad4基因;遗传变异

基金资助：四川省科技厅重点项目（2014NZ0113）；攀西动物疫病检测与防控四川省高校重点实验室基本科研业务费项目（纵341B）