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《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

东串猪FUT2基因CDS扩增、序列分析及组织表达谱检测

来源:中国畜牧兽医杂志2017年第1期北京时间:

作者:钦伟云, 甘丽娜, 赵呈祥, 喻礼怀, 包文斌, 吴圣龙

单位:1. 扬州大学, 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室, 扬州 225009;2. 江苏省种猪繁育和健康养殖工程技术研究中心, 扬州 225009

摘要:猪α-(1,2)岩藻糖转移酶2(FUT2)基因为鞘糖脂生物合成-球系列通路中的重要基因,可能在断奶仔猪抵抗大肠杆菌F18侵染过程中发挥着调控作用。为探究猪FUT2基因的序列结构及其生物学功能,试验采用PCR扩增得到地方猪品种东串猪FUT2基因的CDS全序列,进而预测和分析FUT2基因的蛋白质序列及其功能区域,同时对其在8头35日龄东串断奶仔猪11个组织中的表达水平进行检测与分析。结果显示,FUT2基因的CDS序列全长为1 023 bp,共编码340个氨基酸,FUT2蛋白为脂溶性的亲水蛋白,蛋白结构不稳定,该蛋白存在1个跨膜螺旋结构,但不存在信号肽,表明FUT2蛋白为膜蛋白;FUT2蛋白存在2个N-糖基化位点(185和305位氨基酸),无O-糖基化位点,此外该蛋白还存在14个潜在的磷酸化位点,包括6个Ser、2个Thr和6个Tyr,对其功能区域进行分析发现,FUT2蛋白存在1个超级家族保守结构域:FUT1-FUT2-like(58-319位氨基酸);系统进化树结果显示,猪与牛的亲缘关系相对较近,与人、黑猩猩、大鼠和小鼠等亲缘关系相对较远;FUT2基因在东串断奶仔猪11个组织中均有表达,在消化道和免疫组织中表达水平较高。试验结果推测FUT2基因在断奶仔猪抵抗大肠杆菌F18中可能具有一定的作用,且可能是通过合成岩藻糖转移酶间接发挥其抵抗大肠杆菌F18的作用。

关键词:猪;FUT2基因')">FUT2基因;蛋白结构与功能;表达谱

基金资助:国家科技支撑计划(2015BAD03B01);江苏省科技支撑计划(BE2012330);苏州市科技支撑计划(SNG201410);太仓市产学研联合创新资金(TC2014CY1)

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