《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析
作者:付绍印, 何小龙, 王标, 李虎山, 储明星, 刘永斌, 张文广
单位:1. 内蒙古农牧业科学院, 呼和浩特 010031;2. 内蒙古农业大学动物科学学院, 呼和浩特 010018;3. 内蒙古ATCG生物信息研究所, 呼和浩特 010020;4. 巴彦淖尔市家畜改良工作站, 巴彦淖尔 015000;5. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 农业部畜禽遗传资源与种质创新重点实验室, 北京 100193
摘要:试验通过对巴美肉羊性腺轴进行转录组分析,旨在挖掘影响多羔性状的关键功能基因。分别选取双羔组巴美肉羊5只、单羔组4只,利用转录组测序(RNA-Seq)技术对下丘脑、垂体、卵巢转录组文库进行测序,然后对得到的测序数据进行生物信息学分析。测序数据经过质量控制后,27个样品共得到112 Gb的有效数据。差异基因分析表明,与单羔组相比,双羔组下丘脑中,上调表达基因111个,下调表达基因106个;垂体组织中,上调表达基因97个,下调表达基因142个;卵巢组织中,上调表达基因182个,下调表达基因67个。功能富集性分析表明,神经活性的配体-受体相互作用信号通路在下丘脑-垂体-卵巢性腺轴调控排卵及卵泡发育方面发挥着重要的调控作用。通过不同产羔数巴美肉羊性腺轴比较转录组研究,提供了全部的转录本信息,筛选了影响产羔数的相关功能基因,丰富和补充了绵羊基因组信息,为进一步阐明绵羊繁殖力差异的分子机制奠定基础。
关键词:巴美肉羊;性腺轴;比较转录组
基金资助:国家自然科学基金项目(31360542);国家肉羊产业技术体系建设项目(CARS-39);内蒙古自治区农牧业科学院创新基金(2015CXJJM02);内蒙古自治区自然科学基金博士基金(2016BS(LH)0303);中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS13)