广东新型鸭呼肠孤病毒σB蛋白基因克隆及序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第2期北京时间：

作者：黄雯晶, 梁国智, 梅敏敏, 李晓文, 黄淑坚

单位：佛山科学技术学院生命科学与工程学院, 佛山 528200

摘要：为研究广东新型呼肠孤病毒（NDRV）的基因变异及遗传演化情况，本试验从广东不同鸭场病死鸭肝脏、脾脏等组织脏器中分离到8株流行毒株，用RT-PCR方法进行σB蛋白基因扩增、克隆与序列分析，并与其他毒株σB蛋白的氨基酸特性、蛋白抗原和蛋白基因进行系统进化比对分析。结果表明，广东省鸭群中感染的NDRV与国内其他地区报道的DRV核苷酸序列同源性很高，达96.6%~99.5%，而与禽呼肠孤病毒（ARV）和番鸭呼肠孤病毒（MDRV）的同源性则较低，分别为64.6%~66.5%和66.2%~67.1%；8株NDRV之间的核苷酸序列同源性高达97.7%~99.7%。与其他毒株比较结果显示，本试验分离的NDRV毒株磷酸化位点均比参考毒株ARV和MDRV少，且大多数区域的抗原指数都较高，抗原性与MDRV较为接近，遗传进化分析结果表明，NDRV和国内其他DRV处于独立的进化分支，ARV和MDRV则处于不同分支。结果表明，广东省流行的NDRV毒株σB蛋白基因序列高度保守，且广东地区分离的NDRV与国内其他地区分离的DRV没有明显的地域差异。

关键词：新型呼肠孤病毒;σB蛋白;克隆;序列分析

基金资助：广东省家禽重大传染病控制技术研究（2012A020100001）