猪圆环病毒2型江西株的全基因组克隆和序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第3期北京时间：

作者：蔡高峰, 李凯, 张黎, 王伟松, 何后军

单位：江西农业大学动物科学技术学院, 南昌 330045

摘要：为了解江西地区猪圆环病毒2型（PCV-2）的流行和进化情况，根据GenBank上已发表的PCV-2全基因序列设计1对引物，PCR扩增后得到9条PCV-2全基因序列，并对其全基因序列核苷酸和蛋白序列进行分析，绘制遗传进化树。结果表明，江西地区流行的9株PCV-2中，基因组序列全长分为8株1 767 bp和1株1 768 bp，9株PCV-2的核苷酸同源性为94.7%~99.9%，与GenBank己发表的PCV-2分离株全基因组同源性介于94.3%~99.8%之间，而9株PCV-2的ORF1核苷酸序列同源性为96.9%~100.0%。ORF2和ORF3编码的蛋白氨基酸序列存在部分位点突变。遗传进化树显示为3种基因型：5株PCV-2b、3株PCV-2d、1株PCV-2a。本研究有助于江西地区PCV-2的监测和防制。

关键词：猪圆环病毒2型;全基因组;序列分析

基金资助：江西省研究生创新专项资金（YC2013-S123）