陆川猪MC1R和KIT基因型鉴定

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第3期北京时间：

作者：秦珂, 黄翔, 曾检华, 王晨, 孙冠杰, 宋德清, 陈瑶生, 刘小红, 何祖勇

单位：1. 中山大学生命科学学院, 有害生物控制与资源利用国家重点实验室, 广州 510006;2. 广东壹号食品股份有限公司, 广州 510620

摘要：为了检测陆川猪种群的纯度，本研究以4个华南地方猪种（莆田黑猪、粤东黑猪、大花白猪、巴马香猪）和3个外来猪种（杜洛克猪、大白猪、长白猪）作为对照，利用PCR测序法对陆川猪群体56个样本的MC1R和KIT基因进行基因型鉴定。测序结果表明，大白猪和长白猪KIT基因内含子17的第1个碱基发生G>A剪接突变，而陆川猪和4个华南地方猪种，以及杜洛克猪中KIT基因型一样，均为野生型的GG基因型；MC1R基因编码区分析表明，以海南野猪MC1R基因型作为参考序列，陆川猪和4个华南地方猪种在MC1R基因编码区存在95Val > Met和102Leu > Pro两个错义突变；MC1R基因非编码区分析表明，与大白猪、长白猪和杜洛克猪相比，陆川猪和4个华南地方猪种MC1R基因的5'UTR分别存在5~6个SNPs，3'UTR存在1个A碱基的缺失。另外，试验对一窝毛色异常的陆川猪仔猪及其亲本的KIT和MC1R基因进行测序分析，结果表明，仔猪及其亲本的KIT基因型均为GG野生型，仔猪和母本的MC1R基因均存在ED1和Ep两种不同的基因型，父本的MC1R基因型为ED1，因Ep对应于皮特兰猪的斑块表型，所以初步判定母本渗入了外来猪种的血统。本研究通过检测陆川猪等8个猪种的毛色相关基因KIT和MC1R基因的基因型，证实了中外猪种间在毛色遗传上的分子差异，为今后深入研究猪毛色遗传的分子调控机理提供参考。

关键词：陆川猪;毛色;KIT基因')">KIT基因;MC1R基因')">MC1R基因

基金资助：科技基础性工作专项（2014FY120800）；广东省省级科技计划（2014B020202001）；广东省扬帆计划（2014YT02H042）；广东省自然科学基金（2016A030313310）；国家转基因生物新品种培育重大专项（2016ZX08006003-006）