树鼩Tssk6基因cDNA克隆、组织表达谱及生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第3期北京时间：

作者：李元吉, 杨明华, 刘芳, 朱方方, 和绍禹, 匡海鸥, 李亚辉

单位：1. 云南农业大学动物科学技术学院, 昆明 650201;2. 云南农业大学食品科学技术学院, 昆明 650201

摘要：本研究旨在克隆出树鼩Tssk6基因cDNA的全长序列，阐明其组织表达谱及基本生物信息学特征。以GenBank中收录的树鼩Tssk6基因mRNA预测序列为参考设计特异性引物，对树鼩Tssk6基因的cDNA全长序列进行克隆，用实时荧光定量PCR检测该基因在树鼩不同组织中的表达情况，并对cDNA序列的CDS区核苷酸序列与蛋白质结构进行了生物信息学分析。结果显示，树鼩Tssk6基因cDNA的CDS区序列长度为822 bp，编码273个氨基酸；Tssk6基因仅表达于树鼩睾丸组织；对树鼩和其他8种哺乳动物Tssk6基因cDNA的CDS区核苷酸序列构建的系统进化树显示，树鼩与人、黑猩猩、恒河猴3种灵长类动物亲缘关系较近，与小鼠、大鼠、金仓鼠3种啮齿类动物亲缘关系较远。本研究为进一步研究树鼩Tssk6基因的功能奠定了基础。

关键词：树鼩;Tssk6基因')">Tssk6基因;cDNA;克隆;生物信息学;实时荧光定量PCR

基金资助：国家自然科学基金（31460308）；云南中科灵长类生物医学重点实验室开放基金（云中科字2016-008号）；国家自然科学基金专项基金（31040055）