6个猪品种CD53基因中结构变异SV184分布频率的研究

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第4期北京时间：

作者：徐倩, 岑永秀, 喻昌燕, 刘畅, 冉雪琴, 王嘉福

单位：1. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025;2. 贵州大学农业工程研究院, 贵阳 550025

摘要：基于香猪全基因组重测序数据，在白细胞表面抗原CD53基因中筛选到一个结构变异（structure variant，SV）184，为了探索不同猪品种间此结构变异是否存在多态性变化，本试验选择香猪、大白猪、糯谷猪、柯乐猪、江口萝卜猪和荣昌猪作为试验动物，采用PCR方法对猪群中SV184的分布频率进行比较研究，应用RT-PCR技术，分析CD53基因的原初转录本序列结构，研究SV184对CD53基因的转录是否有直接影响。结果显示，6个猪品种中SV184的分布频率存在明显差异，香猪以VN基因型为主，其他5个猪品种是NN基因型占优势；计算两种等位基因的频率，香猪以缺失的V等位基因为主，其他5个猪品种以正常的N等位基因为主。选择3种基因型个体的血液样本，逆转录后分析CD53基因的原初转录本的序列，从中检测到缺失型和不缺失的两种转录本形式，提示SV184对CD53基因的转录无直接影响。SV184可作为分子标记用于区分香猪和其他猪品种。

关键词：猪品种;CD53基因')">CD53基因;结构变异;多态性;转录本前体

基金资助：国家高技术研究发展计划（863计划）课题（2013AA102503）；贵州省农业攻关项目（黔科合NY[2013]3073号）；贵州省"百"层次创新型人才项目（黔科合人才2016-4012号）；国家自然科学基金（31672390）