不同遗传背景猪群体黏病毒耐药蛋白1基因多态性分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第4期北京时间：

作者：张立春, 李兆华, 李梦姝, 孙福亮, 曹阳, 朴庆林, 金海国, 张树敏

单位：1. 吉林省农业科学院畜牧分院, 公主岭 136100;2. 延边大学农学院, 延吉 133002

摘要：为探讨不同遗传背景猪黏病毒耐药蛋白1（myxovirus resistance，Mx1）基因的遗传多态性，本试验采用RT-PCR方法扩增克隆出猪Mx1基因并进行生物信息学分析，采用高分辨率熔解曲线法（HRM）对民猪、长白山野猪与民猪杂交猪（简称野杂猪）和大白猪3个群体Mx1基因外显子2区多态性进行分析。结果显示，从民猪及野杂猪中成功克隆出4条Mx1基因mRNA序列。该序列含有1个1 992 bp的完整开放阅读框（ORF），编码663个氨基酸。比较发现4条Mx1基因序列中共含有30个SNPs位点，其中17个SNPs位点引起了氨基酸序列的变异。功能结构域分析发现，大部分氨基酸突变位点位于Mx1基因功能结构域两侧。HRM多态性分析显示，Mx1基因外显子2区DD基因型作为优势基因型在3个群体中具有最高的基因型频率，其中大白猪中DD基因型频率为100%，野杂猪为62.5%，民猪为56.2%。基因多态性分析还发现该区域存在更多的核苷酸及氨基酸突变位点，表明民猪和野杂猪Mx1基因存在更丰富的基因多态性。

关键词：黏病毒耐药蛋白1基因;民猪;大白猪;野杂猪;基因多态性

基金资助：吉林省重点科技公关项目（20140204061NY）