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《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒VP3基因的克隆与序列分析

来源:中国畜牧兽医杂志2017年第4期北京时间:

作者:万春和, 刘荣昌, 程龙飞, 傅光华, 傅秋玲, 施少华, 陈红梅, 黄瑜

单位:福建省农业科学院畜牧兽医研究所, 福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心, 福建省禽病防治重点实验室, 福州 350013

摘要:为明确福建地区是否存在鹅出血性多瘤病毒(goose hemorrhagic polyomavirus,GHPV)感染,本研究对2016年福建省临床送检测19份鸭组织样品进行GHPV检测,结果从1例樱桃谷鸭中检测到GHPV感染阳性(记为GHPV-FJ201601株)。随后根据GenBank中GHPV参考株序列特征,设计针对GHPV的VP3基因特异性引物,利用PCR技术扩增获得GHPV的VP3基因片段。结果显示,GHPV-FJ201601株的VP3基因全长为654 bp,编码217个氨基酸。对编码的VP3蛋白分析发现其理论等电点为9.37,带负电荷氨基酸为23个(Asp+Glu),带正电荷氨基酸为28个(Arg+Lys);不稳定指数为38.43,是一个稳定蛋白;脂肪系数64.33,总平均疏水性指数为-0.744;该蛋白无典型的信号肽切割位点;其亚细胞定位类型为核定位;对其进行磷酸化分析发现,该蛋白存在14个氨基酸磷酸化位点。核苷酸同源性分析显示,不同来源GHPV代表株VP3基因相互之间核苷酸同源性均较高,均不低于99.7%。VP3基因遗传进化结果显示,GHPV-FJ201601株和鹅源GHPV分离株(匈牙利14234株与法国Toulouse Goose 2000株)处于同一遗传进化分支,与鸭源分离株(法国Toulouse Muscovy Duck 2008株、法国Toulouse Mule Duck 2008和中国106株)却处于不同的遗传进化分支,但所有GHPV分离株VP3基因遗传进化均较近。本研究首次证实福建地区樱桃谷鸭群中存在GHPV感染,为丰富不同地区与宿主的GHPV分子流行病学数据提供参考。

关键词:鹅出血性多瘤病毒;樱桃谷鸭;VP3基因')">VP3基因;克隆;序列分析

基金资助:国家水禽产业技术体系(CARS-43);国家自然科学基金(31602068);福建省畜禽疫病防控技术重大研发平台(2014N2003);福建省农业科学院畜牧兽医研究所基金(MYQJ2015(S)-3);福建省属公益类项目(2015R1023-7);福建省自然科学基金(2015J01114)

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