马身猪MEF2A基因4种可变剪接体的克隆和生物信息学分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第4期北京时间：

作者：张旗, 郭晓红, 高鹏飞, 靳玉舒, 李萌, 成志敏, 张宁芳, 乐宝玉, 曹果清, 李步高

单位：山西农业大学动物科技学院, 太谷 030801

摘要：本研究旨在克隆马身猪肌细胞增强因子2A（myocyte enhancer factor 2A，MEF2A）基因的不同剪接体类型。依据转录组测序对可变剪接的预测结果，试验扩增MEF2A基因第5~8外显子之间的编码区，用生物信息学软件分析了马身猪MEF2A基因不同剪接体的序列特性，预测保守结构域，构建系统进化树，比对不同物种MEF2A的氨基酸同源性。结果显示，获得了4个MEF2A基因的剪接体，MEF2A1的第5~8外显子正常剪接；MEF2A2缺失了第5外显子，第6外显子的5'端多出138 bp，第7外显子的3'端多出102 bp；MEF2A3缺失了第5外显子，第6外显子的5'端多出138 bp；MEF2A4第7外显子的3'端多出102 bp。插入的138 bp序列编码的蛋白质中存在1个保守结构域HJURP_C，这可能与MEF2A参与肝细胞纤维化作用有关。MEF2A1和MEF2A4与猪MEF2A1（GenBank登录号:NP_001090890.1）同属于一个亚群，同源性高达98.9%，MEF2A2和MEF2A3与猪MEF2A2（GenBank登录号:NP_001093168.1）同属于一个亚群，同源性分别为98.2%和98.9%。本试验成功克隆了4个MEF2A基因的剪接体，为进一步研究其蛋白功能奠定基础。

关键词：马身猪;MEF2A基因')">MEF2A基因;可变剪接;生物信息学

基金资助：山西省科技创新重点团队项目（201605D131045-24）；三晋学者项目（2016）；山西省农业科技攻关项目（20140311020-5）；山西省高等学校优秀青年学术带头人项目