《中国畜牧兽医杂志》发表论文赏析

版纳微型猪近交系TSARG7基因克隆及功能生物信息学分析

来源:中国畜牧兽医杂志2017年第6期北京时间:

作者:王淑燕, 张霞, 霍金龙, 王配, 张永云, 李卫真, 姚茂东

单位:1. 云南农业大学, 云南省版纳微型猪近交系重点实验室, 昆明 650201;2. 云南农业大学动物科学技术学院, 昆明 650201;3. 云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心, 昆明 650201

摘要:为获得版纳微型猪近交系(Banna Mini-pig inbred line,BMI)TSATG7基因序列并分析组织表达情况,本研究以GenBank中猪及近缘物种的TSARG7基因mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增BMI TSARG7基因,半定量分析10个重要组织的表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析。结果显示,获得了BMI TSARG7基因1 371 bp的编码区序列(GenBank登录号:KU950831,对应的氨基酸登录号:AMY60405),编码456个氨基酸,蛋白质分子质量为52.05 ku,等电点(pI)为9.28。多组织表达分析表明,TSARG7基因在睾丸中高表达,在其他组织中呈中、低表达。功能生物信息学分析表明,TSARG7蛋白质存在1个保守结构域,有3个跨膜螺旋结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端亲水;有5类功能活性位点,位于细胞质的概率是94.1%。本试验结果为进一步研究TSARG7基因在猪精子发生和性成熟方面的作用及功能奠定基础。

关键词:版纳微型猪近交系;酰基转移酶;组织表达;生物信息学

基金资助:国家自然科学基金项目(31660637、31460580、31660650)

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