6株猪流行性腹泻病毒贵州株S基因序列分析

来源：中国畜牧兽医杂志2017年第6期北京时间：

作者：毛黎红, 张双翔, 周碧君, 王伟, 胡兴义, 程振涛, 文明, 王开功

单位：1. 贵州省贵阳市花溪区农业局, 贵阳 550001;2. 贵州省动物疫病预防控制中心, 贵阳 550001;3. 贵州大学动物科学学院, 贵阳 550025

摘要：为了解贵州省猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhea virus，PEDV）S基因的特点，掌握其遗传变异情况，本试验设计3对特异性引物对6株PEDV贵州株S基因进行全基因RT-PCR扩增、克隆及序列测定；应用生物信息学软件将6株PEDV贵州流行株与参考毒株进行同源性与系统进化分析。结果显示，6株PEDV贵州流行株S基因的全基因长为4 161 bp，编码1 387个氨基酸，与国内外PEDV参考毒株核苷酸同源性在93.3%~98.8%之间，氨基酸同源性在91.6%~98.9%之间；进化树分析结果显示，6株流行毒株与美国毒株、越南毒株和山东毒株亲缘关系较近；与CV777株、LZC、Brl、83P-5亲缘关系较远。结果表明，PEDV贵州地方流行毒株S基因编码的氨基酸存在一定程度变化，近年来呈现变异趋势。本研究可为贵州省PEDV的防控提供一定的理论依据。

关键词：猪流行性腹泻;S基因')">S基因;生物信息学分析

基金资助：贵州省科学技术厅农业攻关项目"贵州省仔猪腹泻性疫病风险分析及综合防控技术研究"（黔科合NY[2015]3009-1号）；贵州省生猪质量安全工程技术研究中心建设项目"生猪健康养殖实验室建设与技术研发"黔科合农C字[2011]4022号；贵州省农业委员会科技计划项"2015年贵州省重大动物疫病省级定点监测"[2015-11号]